Не обязательно к хорошему. Лучше к специализирующемуся на интеллектуальных правах.) Регистрация такие действия не ограничит. И, скажем так, "существенных" последствий не имеет, регистрация лишь подтверждает, что на какой-то момент времени у Вас в распоряжении имелся экземпляр программы (программный код), и что Вы указываете себя в качестве правообладателя. Право на программу охраняется и без ее регистрации.
Как вы докажете в суде, что это ваша собственная разработка? Может быть все наоборот? Теперь уже никак не ограничить. Если исходники у вас, сделайте новую версию, уже с защитой. Контролируйте доступ к программе, и особенно к исходникам.